网上申报流程：
1、登录。代表机构登录上海市工商行政管理局网站，凭代表机构登记证上的企业标识和机构名称登录用户界面。
2、填写年度报告书。代表机构登录用户界面后点击“填写年度报告书”按钮。网上申报系统将自动匹配并显示代表机构年度报告书表式。代表机构在线填写年度报告书的过程中，可点击“暂存”按钮暂时保存所填写的内容，可在下次登录时对错漏的内容进行补充修改，直至确认所有填写内容准确完整。
3、打印年度报告书并提交书面材料。代表机构确认填写内容准确完整后点击“提交”按钮。网上申报系统将根据年度报告书中设置的必输项进行判断，不符合要求的，自动提示代表机构进行补充修改；符合要求的，提示代表机构申报成功，并显示打印年度报告书按钮。代表机构打印《申报意见书》和年度报告书，携带《申报意见书》所列材料，在2012年6月30日之前到指定地点提交年度报告。
4、工商部门接收代表机构年度报告。代表机构携带年度报告书和相关材料到受委托的属地工商分局指定地点提交年度报告。工商部门对其提交年度报告材料齐全、内容完整的，予以接收并加盖戳记。
说到企业为什么要参加年检，是因为公司年检其主要目的是要审核这些已登记的公司是否合法经营，是否具有继续经营的能力。其中对注册资本的年检是一个相当重要的内容，因为，有否足够的资本是考核企业是否有持续经营能力的一个重要标志。实质上，注册资本的工商年检是对公司注册资本的一种定期审核，这可在一定程度上防止公司在验资通过后，再来抽逃资金，远比对公司时点资金的验资要可靠的多，这也是为什么要进行工商年检的目的之一。
年报常见问题：
1、年报从哪里登录?
答：全国企业信用信息公示系统是年报官方网站，认准带GOV的网址才是，不要走错路哦。也可以关注微信公众号登记注册小助手，获取年报步骤。
2、是否可以一个手机号关联多个企业，同时担任多个企业联络员?
答：可以。
3、填报“企业资产状况”时，资产总额填写的负数，点保存提示“资产总额只能填写数字”，怎么办?
答：企业填报“资产状况”时，资产总额不能填写负数。
4、用户注册时，提示企业信息有误，怎么办?
答：建议先使用法定代表人的一代身份证试试，注意填写的时候不能有空格或者其他字符。若按以上操作还是不行，建议咨询管辖分局，核实法定代表人的相关信息。
5、进行“企业联络员变更”时，提示联络员信息错误，怎么办?
答：首先核实法定代表人信息是否正确，若信息不正确，也会提示联络员信息错误;若信息正确，再核实联络员信息是否正确;若不确定，则联系登记机关处理。
6、公示系统填报完成年报后，是否需要再去工商部门现场办理年报业务或提交纸质年报材料?
答：不需要，工商部门不对年报进行审核，只是在每年年报结束后，抽取不少于3% 比例的年报企业或个体工商户进行检查。
7、怎么确定年报是否提交成功?
答：企业、个体工商户和农民专业合作社年报填报完不需要工商局审核，提交并公示成功即可。
8、年报填报中-股东及出资信息是美元或其他币种，但不能选择币种，怎么办?
答：所有填写币种均以工商登记机关注册时填写的单位为准。因此年度报告中的“万元”，即代表你企业在工商部门登记时的万美元或万欧元或万港币等，不需要换算
当前，对于市场中的广大中小企业来说，其在经营期间也需按政策要求在规定时间内按时完成工商年报填报工作。因此，对于对该项业务办理不够了解的企业来说，其往往对“中小企业填报工商年报需要注意什么”这一问题格外关注。
一般情况下，有关于中小企业填报工商年报所需注意问题，其主要包括以下这些：
1、内容填写要真实
因为现在是自主公示，公示之后工商机关再进行抽查，因此，中小企业要对工商年报内容的真实性负责，一旦发现有虚假捏造，要承担相应的法律责任。
2、明确所需填写信息
年度报告中的所有信息项都是必填项，如果某一项内容确实没有信息，选择“无”，不可不填。
3、知晓信息时间节点
在填报的内容中，通信地址、邮政编码、联系电话、电子邮箱、存续状态、网址、网站信息都应是在报送年报时的真实信息，其他的信息为年度报告年份截止12月31日的信息。
4、股东出资额
现在注册公司实行认缴制，每个股东的认缴额以及实缴的出资额都只有一条信息记录，时间截止年度报告年份12月31日的累计数额。认缴和实缴的出资时间为后一次认缴和实缴的出资时间，出资方式可以多选，是所有出资方式的综合。关于这一点，中小企业在填报年报时需多加注意。5、股东姓名
股东的姓名或名称要与工商登记机关的姓名和名称一样。
6、资产数据
关于中小企业资产的状况信息，其数据应该是企业年度资产负债表和损益表（利润表）中的期末数；币种是人民币，万元为单位，数据小数点后保留两位；纳税总额是企业全年缴纳的各类税金的总额。
7、资产状况
关于中小企业资产状况的信息和从业人员，这部分信息是非强制性公示事项，中小企业可以选择是否向社会公示。其中，对外担保信息可以选择某条具体信息是否向社会公示。
8、填写错误可以更正
如果发现年报内容有错漏，可以在6月30日之前完成改正。改正前后的信息都要进行公示，因此，中小企业在填报时要谨慎填报，填写信息之后要自行检查，尽量避免发生填写错误的问题。